東京喰種

東京，這裡潛伏著混在人群中並捕獵人類的怪物「喰種」。喜歡閱讀的大學生－金木研，在常去的咖啡廳「安定區」裡，遇到了同樣喜歡小說家－高槻泉作品的神代利世，兩人約好要一起去書店約會。但金木還不知道，之後發生的意外事故將改變自己的命運…。金木雖在事故裡受了重傷，但經過手術後撿回一命。而當金木醒來後卻發現“不管吃什麼都覺得很難吃”，漸漸察覺自己產生異變…!?

金木被屍體的香味吸引，而和身為喰種的錦對峙。這時救了他的是安定區的店員－霧嶋董香和店長芳村。芳村將某個小包裹拿給受喰種的飢餓所苦的金木。隔天，看了英的簡訊而回到大學的金木，英介紹了一位姓「西尾」的學長給他認識，而這位學長就是先前和他對峙的喰種－「錦」。他雖然表現的與普通人沒兩樣，但在回家路上卻突然襲擊英，並害英昏了過去。 “抱歉弄髒了你的食物”，錦在金木面前又露出了身為喰種的本性!?

身為喰種的笛口涼子和她的女兒雛實暫時躲到了「安定區」生活，雛實臉上孤單的表情讓金木感到很在意。此時，金木和芳村的得力助手四方蓮示一起為了無法狩獵的喰種調度食糧。另一面，目的為殲滅東京所有喰種的CCG在利世的事件發生後，就把「安定區」所在的20區列進了搜索範圍裡。身為上等搜查官的真戶吳緒和亞門鋼太朗一同前往了20區…

被稱為「美食家」的喰種－月山習造訪安定區。董香露出厭惡的表情，直指他是20區的麻煩人物，並警告金木不要和月山扯上關係，但是月山盯上了金木身上的特殊香味，不斷設法與金木接觸。金木在意起利世造成自身悲劇的原因，他被月山口中「利世常去的店」所吸引，來到了「喰種餐廳」。

因董香身體不適而去探望她的金木，發現董香非常重視名為依子的人類朋友。而在回程時，金木救了被喰種攻擊的錦。金木將錦送回住處並遇見了錦的戀人－西野貴未。貴未雖然知道錦是喰種，卻仍和錦一起生活。但之後貴未卻被悄悄跟蹤金木的月山抓走。金木和錦一起去救貴未，但……

金木在安定區教雛實識字。認識了越來越多字的雛實，為了學習更多字給父親一個驚喜，和涼子一起出門買書。但這時CCG的搜索官草場和中島正好在附近搜尋喰種母女。早一步注意到異狀的涼子立刻拉起雛實的手想要逃走，但這時雛實卻查覺到了某個"異變"…

雛實的母親・涼子被CCG搜查官真戶奪去了性命，金木對於自己什麼都做不到感到十分懊悔。另一面，董香得知這個消息後，向芳村表示應該要報仇，但芳村以眾人的安全為由，否決了她的提議，並說雛實的臉已經被搜查官看到，因此要把她移到24區。無法接受的董香想著涼子和雛實的事，悄悄下了一個重要的決心。

雛實偷偷離開安定區，然而那是真戶設下的巧妙陷阱。董香才剛找到雛實，真戶就出現在她面前。同一時刻，一樣在找雛實的金木正與另一位搜查官亞門對峙。在戰鬥中，亞門質問金木「有沒有想過那些被喰種奪走親人，其遺族所承擔的傷痛?」，並斷言是喰種讓這個世界扭曲。

「安定區」的人們總算逐漸回到以往的日常生活了。此時金木為了更了解關於改變自己命運的利世的情報，獨自拜訪了14區的酒吧「Helter Skelter」。在那裡，同為喰種的系璃告訴他利世以前曾待過11區。另一面，11區謎樣的喰種們，正展開一連串可疑的行動…？

CCG的11區分部，被自稱為「青桐樹」的喰種集團攻擊，沒有倖存者。得知這件事後，CCG開始準備有史以來最大規模的討伐戰。另一方面，有個名為萬丈數壹的男人闖進了安定區，他十分仰慕利世，在得知「青桐樹」的目標是利世後，便來到安定區想勸利世逃走。但這時「青桐樹」的少年幹部－「絢都」卻突然出現在眾人面前。看到他之後，董香面露驚訝的神情！

為了救出被「青桐樹」抓走的金木，芳村、四方、董香、錦、雛實與詩齊聚一堂，此外還加入一位意想不到的人物!CCG的亞門一行人與其他搜查官，準備以超越千人的陣仗進攻位於11區的青桐樹據點。 「青桐樹」與CCG，還有安定區的三方之戰一觸即發…

在「青桐樹」的據點展開的戰鬥越來越激烈了。喰種與人類之戰…這場戰鬥會如何收尾？ 「安定區」的夥伴有辦法救出金木嗎？另一方面，被青桐樹的幹部之一——壁虎帶走的金木，遭受了超乎想像的殘忍虐待。意識朦朧的金木，他內心世界突然出現的人物是…？